КАФ розділяє Африканський континент на шість географічних зон; в чотирьох з них діють футбольні конфедерації нижчого рівня. Зони використовуються для проведення зональних футбольних турнірів (які, як правило, проводяться за олімпійською системою з вибуванням для зменшення кількості матчів), а також для проведення відбірного турніру Африканських ігор (від кожної зони до фінальних змагань потрапляє одна команда, від південної зони — дві).

• Зона 1 — північна: Алжир, Єгипет, Лівія, Марокко, Туніс.
• Зона 2 — західна A: Гамбія, Гвінея, Гвінея-Бісау, Кабо-Верде, Ліберія, Мавританія, Малі, Сенегал, Сьєра-Леоне.
• Зона 3 — західна B (УФОА): Бенін, Буркіна-Фасо, Гана, Кот-д’Івуар, Нігер, Нігерія, Того.
• Зона 4 — центральна (УНІФАК): Габон, Екваторіальна Гвінея, Камерун, Конго, ДР Конго, Центральноафриканська Республіка, Чад.
• Зона 5 — центрально-східна (СЕКАФА): Бурунді, Джібуті, Еритрея, Ефіопія, Кенія, Руанда, Сомалі, Судан, Танзанія, Уганда.
• Зона 6 — південна (КОСАФА): Ангола, Ботсвана, Коморські острови, Замбія, Зімбабве, Лесото, Мадагаскар, Маврикій, Малаві, Мозамбік, Намібія, Південна Африка, Свазіленд, Сейшельські острови.

Географічні зони КАФ